《马里奥赛车Wii》共支持5种操作方法，分别是方向盘、Wii控制器、Wii moto组合控制器，SFC手柄以及NGC手柄。
行进和方向盘操作
按住②键可以使赛车前进，前进过程中，左右扭转方向盘操纵赛车改变方向。
自动漂移
扭转Wii方向盘，赛车就会变成横向滑行的自动漂移状态，这样就可以在不减速的情况下顺利拐弯。
道具使用
道具的使用通过十字键实现。道具前后投掷通过按前键或者后键实现，这样即使手握方向盘也可以做到。
后视
按住A键进行后方视点的切换，确认后方敌人的状态。
刹车和倒车
停止行进时按住①键可以刹车，持续按住①键则可以使赛车后退。
蓄力
比赛开始的计数时，某个时刻按住②键可以比通常更快速的冲出。
漂移和迷你涡轮增压状态
行进过程中按住B键同时扭转方向盘可以进行漂移，漂移中，外轮胎出现蓝色火花时漂移结束，短时间内持续涡轮增压的冲刺状态。（自动漂移时涡轮无法增压）
超级迷你涡轮增压
漂移时，蓝色火花出现后短时间内持续漂移的状态，这个状态下出现橘黄色的火花，此时解除漂移的话可以实现较长时间的冲刺，就会出现超级迷你涡轮增压状态。
飞跃
冲向跳跃台的瞬间，向上下左右任意方向挥动方向盘可以再飞跃中做出各种动作，成功的话，着地时会进入短时间的冲刺状态。
摩托特技
摩托行进中，上扬方向盘，一定时间进入后轮独轮行进状态，此状态下速度上升，但是难以拐弯。此技能仅限摩托，其他种类赛车则因为不稳定而减速。
